帆船嶼高約34公尺，因遠眺有如帆船一般而得名，將軍村民則稱為「將門嶼」。退潮時與將軍澳嶼相連，古時候航行附近的大大小小船隻都以它為標幟。

望安以盛產文石著稱，其中將軍嶼更是澎湖良質文石的重要產地，大多產於多孔狀玄武岩層中。這種文石主要是由碳酸鹽礦物及蛋白石、褐鐵礦等所組成，以具有同心圓花紋或稱之為「眼」，經琢磨加工而成各種裝飾品，價值較高。